Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATRAIDQ6UW56 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATRAIDQ6UW56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms