Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A1Q6PCB7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms