Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRNIPQ6NTE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRNIPQ6NTE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms