Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATL3Q6DD88 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATL3Q6DD88 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms