Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOCADQ5VW36 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOCADQ5VW36 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms