Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DIPQ5VU43 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE4DIPQ5VU43 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4DIPQ5VU43 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4DIPQ5VU43 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms