Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SOGA3Q5TF21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SOGA3Q5TF21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms