Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEND3Q5T5X7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEND3Q5T5X7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms