Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCH8Q5T0T0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCH8Q5T0T0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms