Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LDLRAP1Q5SW96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms