Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CEP78Q5JTW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CEP78Q5JTW2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms