Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC178Q5BJE1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC178Q5BJE1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms