Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB6CQ53S08 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248 ms