Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD39Q53RE8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms