Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL12Q53G59 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL12Q53G59 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms