Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYTL3Q4VX76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms