Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT71Q3SY84 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms