Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HFEQ30201 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HFEQ30201 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HFEQ30201 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HFEQ30201 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HFEQ30201 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HFEQ30201 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HFEQ30201 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HFEQ30201 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms