Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETM2Q2VYF4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETM2Q2VYF4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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