Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NREPQ16612 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NREPQ16612 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NREPQ16612 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NREPQ16612 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NREPQ16612 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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