Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCAQ16586 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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