Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX1Q16384 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SSX1Q16384 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX1Q16384 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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