Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SNCBQ16143 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
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SNCBQ16143 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SNCBQ16143 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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SNCBQ16143 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SNCBQ16143 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCBQ16143 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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