Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIBQ15653 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFKBIBQ15653 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIBQ15653 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIBQ15653 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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