Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAM1Q15629 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM1Q15629 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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