Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDSNQ15517 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDSNQ15517 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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