Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRRQ15256 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRRQ15256 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms