Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRLQ15198 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRLQ15198 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRLQ15198 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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