Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRD3Q15059 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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BRD3Q15059 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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BRD3Q15059 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRD3Q15059 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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