Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD6Q15008 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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