Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL4A6Q14031 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
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