Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUL4BQ13620 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms