Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KRR1Q13601 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KRR1Q13601 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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