Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PPP1R1AQ13522 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP1R1AQ13522 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms