Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCIRG1Q13488 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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