Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGADQ13349 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGADQ13349 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms