Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
GRIN2BQ13224 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2BQ13224 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2BQ13224 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
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