Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL28Q13084 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL28Q13084 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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