Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRDNQ13061 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRDNQ13061 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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