Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK3Q13003 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK3Q13003 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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