Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB3Q12988 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HSPB3Q12988 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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