Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD4Q12950 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXD4Q12950 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms