Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TP53BP1Q12888 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TP53BP1Q12888 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms