Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCB1Q12824 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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