Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNH2Q12809 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH2Q12809 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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