Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAGPQ0VAQ4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms