Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PUDPQ08623 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PUDPQ08623 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms