Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EGR3Q06889 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms