Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABPB1Q06547 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms