Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN11Q06124 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms